Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms