Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms