Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm1Q60636 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms