Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms