Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabl6Q5U3K5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms