Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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Trim38Q5SZ99 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Trim38Q5SZ99 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Trim38Q5SZ99 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim38Q5SZ99 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms