Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AbrQ5SSL4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AbrQ5SSL4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms