Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH8

Cyb5d2, Neuferricin, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb5d2Q5SSH8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyb5d2Q5SSH8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyb5d2Q5SSH8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyb5d2Q5SSH8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyb5d2Q5SSH8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyb5d2Q5SSH8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb5d2Q5SSH8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb5d2Q5SSH8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb5d2Q5SSH8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb5d2Q5SSH8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb5d2Q5SSH8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb5d2Q5SSH8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb5d2Q5SSH8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb5d2Q5SSH8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb5d2Q5SSH8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyb5d2Q5SSH8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms