Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms