Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf12Q5SPL2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms