Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlha9Q5RJB0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlha9Q5RJB0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms