Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rtp3Q5QGU6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms