Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
1810065E05RikQ5NC41 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms