Protein–RNA interactions for Protein: Q5F2E7

Nufip2, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip2Q5F2E7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nufip2Q5F2E7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nufip2Q5F2E7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms