Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkaa1Q5EG47 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms