Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms