Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms