Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Spire1Q52KF3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms