Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdv3Q4VAA2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdv3Q4VAA2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms