Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc3lQ4KL14 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc3lQ4KL14 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms