Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms