Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc27Q3V036 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms