Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm5aQ3UXZ9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm5aQ3UXZ9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms