Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clpsl2Q3UW21 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms