Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

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Length 74 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim15Q3UTD9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms