Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms