Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fchsd2Q3USJ8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fchsd2Q3USJ8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms