Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28047Q3US59 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm28047Q3US59 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms