Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef40Q3UPH7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgef40Q3UPH7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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