Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlrc4Q3UP44 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms