Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc4Q3UP24 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms