Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms