Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sf3b2Q3UJB0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms