Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Greb1Q3UHK3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms