Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6cQ3UHC0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms