Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll12Q3UDE2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll12Q3UDE2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll12Q3UDE2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll12Q3UDE2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll12Q3UDE2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll12Q3UDE2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll12Q3UDE2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll12Q3UDE2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll12Q3UDE2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll12Q3UDE2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll12Q3UDE2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll12Q3UDE2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll12Q3UDE2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll12Q3UDE2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll12Q3UDE2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms