Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cops9Q3U898 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Cops9Q3U898 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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