Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd3Q3U487 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd3Q3U487 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms