Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hace1Q3U0D9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms