Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd6Q3TY92 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms