Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fbxw18Q3TSA9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fbxw18Q3TSA9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms