Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarca4Q3TKT4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms