Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hddc2Q3SXD3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms