Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Ttc39dQ0VF76 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Ttc39dQ0VF76 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Ttc39dQ0VF76 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Ttc39dQ0VF76 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Ttc39dQ0VF76 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Ttc39dQ0VF76 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Ttc39dQ0VF76 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Ttc39dQ0VF76 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Ttc39dQ0VF76 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Ttc39dQ0VF76 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Ttc39dQ0VF76 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc39dQ0VF76 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Ttc39dQ0VF76 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Ttc39dQ0VF76 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Ttc39dQ0VF76 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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