Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rundc1Q0VDN7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms