Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrioQ0KL02 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms