Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MestQ07646 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MestQ07646 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MestQ07646 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MestQ07646 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MestQ07646 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MestQ07646 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MestQ07646 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MestQ07646 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MestQ07646 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MestQ07646 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MestQ07646 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MestQ07646 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MestQ07646 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MestQ07646 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MestQ07646 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MestQ07646 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MestQ07646 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MestQ07646 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MestQ07646 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MestQ07646 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MestQ07646 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MestQ07646 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MestQ07646 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MestQ07646 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms