Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms