Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs3Q05895 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms