Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smpd1Q04519 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms